如何批量检索 PubChem？环境监测数据库推荐

? 如何批量检索 PubChem？环境监测数据库推荐

在科研和环境监测领域，数据检索和分析是日常工作的重要环节。PubChem 作为全球知名的化学数据库，提供了海量的化合物信息，而环境监测数据库则为环境研究提供了关键数据支持。今天咱们就来聊聊如何高效地批量检索 PubChem，以及有哪些实用的环境监测数据库值得关注。

? 批量检索 PubChem 的实用方法

PubChem 是美国国家医学图书馆（NLM）维护的免费化学数据库，收录了超过 1.18 亿种化合物的结构、性质和生物活性数据。对于需要处理大量化合物数据的用户来说，批量检索功能尤为重要。以下是几种常用的批量检索方法：

? 通过官网上传 ID 列表

这是最直接的方法。打开 PubChem 官网，点击首页的 UPLOAD ID LIST 进入检索界面。你可以下载示例数据模板，按照要求填写化合物的名称、CAS 号、SMILES 码等信息，保存为 CSV 或 TXT 文件后上传。系统会自动识别并检索相关化合物，结果支持批量下载。这种方法适合非技术背景的用户，操作简单，但一次上传的数据量有限，适合小规模检索。

? 使用 Python 库 PubChemPy

如果你熟悉编程，PubChemPy 是个不错的选择。它是 PubChem PUG REST 服务的 Python 接口，支持从化合物名称、CID 等多种标识符检索信息，并能获取 IUPAC 名称、分子式、分子量等多种属性。例如，使用 get_compounds 函数可以批量查询化合物的 2D 或 3D 结构信息，get_properties 函数则能一次性获取多种属性数据。不过要注意，当检索结果超过 5 个时，可能会出现超时问题，建议设置 try-except 异常处理或调整检索参数。

?️ 调用 PubChem API

对于技术能力较强的用户，直接调用 PubChem 的 REST API 可以实现更灵活的批量检索。通过发送 HTTP 请求，你可以指定检索参数、数据格式（如 JSON、XML）和返回字段。例如，使用 requests 库发送请求，获取化合物的详细信息并解析为结构化数据。这种方法适合需要自动化处理大量数据的场景，但需要一定的编程基础和对 API 文档的熟悉。

? 环境监测数据库推荐

环境监测涉及水、大气、土壤等多个领域，以下是一些权威且实用的数据库，涵盖了环境质量、污染源、生态数据等方面：

? 美国 EPA 数据库

TRI Toolbox：美国 EPA 的有毒物质释放清单（TRI）数据库，提供工业设施的有毒化学品排放数据。用户可以通过地图搜索附近的设施，查看化学品释放量、处理方式等信息，还能生成报告和对比分析。
Envirofacts：整合了 EPA 多个项目的数据，包括空气、水、废、毒等环境要素。支持按设施名称、化学品、地理位置等条件检索，适合环境监管和研究人员使用。

?? 欧盟 ECHA CHEM

欧洲化学品管理局（ECHA）的全新化学品数据库，整合了 REACH 注册信息和其他化学品数据。用户可以通过 EC/CAS 号、名称等检索物质信息，查看注册卷宗、理化性质、毒理学数据等，并支持 Excel 格式导出。新系统界面更清晰，数据更新及时，是化学品安全评估的重要工具。

?? 中国生态环境监测数据库

全国环境监测数据平台：由中国生态环境部建设，集成了地表水、空气质量、土壤等环境要素的监测数据。用户可以查询国控、省控监测站点的实时数据和历史记录，了解全国环境质量状况。
重庆环评监测数据一键查：重庆市生态环境局开发的系统，为环评编制单位和建设单位提供免费的环境质量监测数据。用户只需上传项目备案证明和数据需求清单，即可在 1.5 个工作日内获取所需数据，大大缩短了环评编制时间。

? 海洋与生物多样性监测数据库

全球海洋生物多样性及环境因子数据库：由中国科学院海洋科学数据中心发布，整合了 OBIS、GBIF 等国际数据库的海洋生物发生数据，以及 CMEMS 的环境因子数据。包含 1.42 亿条记录，覆盖 20 多万种海洋生物，提供物种分布、环境因子（如温度、盐度、叶绿素）等信息，支持申请共享。
海洋生物地理信息系统（OBIS）：国际海洋生物普查计划的成果，包含全球海洋生物的分布、丰度和栖息地信息。用户可以通过地图查看物种分布热点，分析生物与环境的关系，数据更新至 2021 年。

? 数据整合与分析工具

除了数据库本身，一些工具可以帮助用户更好地处理和分析环境监测数据：

? 物联网与大数据平台

物联网技术为环境监测带来了实时、高效的数据采集能力。例如，基于 ESP32 和 KWDB 的智能环境监测系统，通过传感器实时采集温湿度、空气质量等数据，上传至云端数据库进行存储和分析。用户可以通过可视化界面查看数据趋势，设置预警阈值，实现智能化管理。

? 碳监测与评估工具

全球基础设施排放数据库（GID）：由清华大学团队研发，提供全球 0.1°×0.1° 分辨率的二氧化碳排放数据，包括电力、工业、交通等六个部门的单独排放数据。适合气候变化研究和政策制定。
Carbon Monitor：全球实时碳数据库，提供日分辨率的全球碳排放数据，覆盖电力、工业、运输等部门。用户可以查看各国的碳排放趋势，分析减排措施的效果。