PubChem 作为全球领先的化学信息资源平台，一直是科研人员和药物开发者的重要工具。2025 年的新版升级，更是让其专利分析功能迎来了一次全面革新。这次升级不仅大幅提升了数据覆盖范围，还引入了多项智能化工具，让专利分析变得更高效、更精准。
? 数据整合全面升级，覆盖范围大幅扩展
2025 年的 PubChem 新增了来自 130 多个新数据源的数据，使平台包含超过 1000 个数据源、1.19 亿种化合物、3.28 亿种物质和 2.95 亿种生物活性数据。这意味着用户在进行专利分析时，能够获取更全面、更丰富的信息。
就拿药物研发来说，过去研究人员可能需要在多个数据库之间切换，才能收集到足够的专利信息。现在，PubChem 整合了大量数据，用户只需在一个平台上就能完成从化合物结构到生物活性的全方位分析。比如，在分析某一药物的专利布局时，用户不仅可以查看该药物的核心专利，还能轻松获取与之相关的上下游技术专利，从而更全面地了解该领域的技术发展脉络。
此外，PubChem 还改进了对非离散结构化学品的信息可用性，通过专门的网页提供这些化学品的全面信息。这对于研究生物制剂、矿物、聚合物等复杂物质的科研人员来说，无疑是一个重大利好。
? 专利知识面板上线，深度挖掘专利价值
新版 PubChem 的一大亮点是推出了专利知识面板。这个功能可以展示在专利文档中与查询化学品或基因共同提及的化学品、基因和疾病，帮助用户探索专利文档中的实体关系。
想象一下，当你在分析某一化合物的专利时，专利知识面板会自动关联出与该化合物在专利中同时出现的其他化学品、相关基因以及涉及的疾病。这不仅能帮助用户快速发现潜在的技术关联，还能为后续的研究提供新的思路。例如，通过分析专利中共同提及的基因和疾病，研究人员可以更精准地确定药物的作用靶点，加速新药研发进程。
另外，专利知识面板还支持数据的导出和可视化，用户可以将相关信息以表格或图表的形式保存下来，方便进一步分析和分享。
? 智能化工具助力，提升分析效率
为了满足用户对高效分析的需求，2025 版 PubChem 引入了多项智能化工具。例如，平台整合了机器学习和大型语言模型（LLM）辅助数据提取和文本生成，提升了信息提取效率。这意味着用户在处理大量专利文献时，系统能够自动提取关键信息，生成简洁明了的分析报告，大大节省了时间和精力。
在专利分类方面，新版 PubChem 完善了专利类型的分类，过滤掉无效图示，并新增了专利类型分析功能，包括医药用途、晶型、工艺、制剂专利等。用户可以根据自己的需求，快速筛选出符合条件的专利，提高了检索的准确性和效率。
同时，平台还增加了药物类型分析和 MNC 标注功能。药物类型分析可以帮助用户了解不同类型药物的专利分布情况，而 MNC 标注则能让用户快速识别跨国公司的专利布局，为制定知识产权战略提供参考。
? 文献整合与可视化，增强信息获取体验
除了专利分析功能的升级，2025 版 PubChem 还优化了文献整合与可视化功能。平台开发了整合文献面板，将所有关于某一化合物的文献整合到一个列表中，便于用户查找、排序和导出相关文章。这对于需要大量阅读文献的科研人员来说，无疑是一个非常实用的功能。
在数据可视化方面，PubChem 扩展了 PubChemRDF，包括文献知识面板的共现数据，使用户能够利用语义网技术探索基于科学文献中实体共现的关系。通过可视化工具，用户可以直观地看到化合物、基因、疾病等实体之间的关联，从而更深入地理解相关研究的脉络。
此外，平台还优化了网站界面，新增了基因组坐标和蛋白质复合物可视化功能，改善了用户体验。用户可以通过直观的图表和图形，快速了解相关数据的分布和关系。
?️ API 功能优化，支持更灵活的数据分析
对于需要进行批量数据处理和自动化分析的用户，2025 版 PubChem 对 API 功能进行了优化。平台新增了支持目标中心数据下载的功能，用户可以根据给定的蛋白质、基因、途径、细胞系和分类单元下载相关数据。这使得用户能够更灵活地获取所需数据，满足不同的研究需求。
同时，PUG-REST 协议新增了 “standardize” 选项，能够返回输入化学结构的标准化形式。这对于需要进行结构分析和比较的用户来说，非常实用。例如，在进行药物设计时，用户可以通过标准化结构，快速比较不同化合物的结构差异，从而筛选出更具潜力的候选药物。
? 实际应用场景解析
新版 PubChem 的专利分析功能在多个领域都有广泛的应用前景。在新药研发领域，研究人员可以利用平台的专利知识面板和文献整合功能，快速了解某一药物的专利布局和研究进展，从而避免重复研究，加速新药的开发进程。例如，通过分析专利中共同提及的基因和疾病，研究人员可以更精准地确定药物的作用靶点，提高研发效率。
在知识产权管理方面，企业可以利用 PubChem 的专利类型分析和 MNC 标注功能，快速了解竞争对手的专利布局，制定有效的知识产权战略。例如，通过分析跨国公司的专利分布情况，企业可以提前规划专利申请策略，避免侵权风险。
对于科研机构来说，PubChem 提供的丰富数据和智能化工具，可以帮助研究人员进行科学研究和技术创新。例如，通过整合文献面板和专利知识面板，研究人员可以快速获取相关领域的最新研究成果和专利信息，为自己的研究提供参考和灵感。
? 总结
2025 版 PubChem 的升级，无疑是化学信息领域的一次重大突破。通过全面的数据整合、智能化工具的引入以及用户体验的优化，PubChem 为科研人员和药物开发者提供了更高效、更精准的专利分析解决方案。无论是在新药研发、知识产权管理还是科学研究领域，新版 PubChem 都展现出了强大的应用价值。
对于广大用户来说，充分利用 PubChem 的这些新功能，不仅能提升工作效率，还能为自己的研究和工作带来更多的创新机会。相信在未来，PubChem 将继续引领化学信息领域的发展，为全球的科研和产业创新提供有力支持。
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